第1話　校舎裏の階段に、私の死に方が書いてある

第2話　湖畔で拾った透明な靴

第3話　全校集会が二番目だらけになる

第4話　穴あけパンチは告白を殺す

第5話　アサフェティダ防衛戦

第6話　忘れられないキスを私は覚えていない

第7話　永遠の神殿へようこそ

第8話　インファイト探偵団、廃礼拝堂へ行く

第9話　太一が隠していた動画

第10話　二番目に好きな人しか残らない

第11話　透子の正しさは怖い

第12話　可苗は優しく穴を開ける

第13話　アサフェティダの匂いで告白する

第14話　黒いペンは誰の手にある

第15話　一年前、茅那は湖で死んだ

第16話　美悠、二番目の人生を契約する

第17話　スマホの中で世界が壊れる

第18話　透明な靴が両足そろう夜

第19話　永遠の神殿は、優しさで人を閉じ込める

第20話　君のために世界を壊す、を言い換えろ

第21話　穴だらけの願いカードを燃やせ

時間を無駄にせず、毎日少しでも成長することを信条にしている高校生・茅那。
　ある朝、いつもの近道である校舎裏の階段に、黒いペンで書かれた奇妙な文章を見つける。
「茅那、二番目に好きな人に殺される」
　その下には、薄く重ねられた「湖畔へ行け」という言葉と、靴の形に並んだ小さな穴が残されていた。
　霧に包まれた湖畔へ向かった茅那は、水の膜のように透き通った片方の靴を拾う。靴は勝手に茅那の足へまとわりつき、二度と脱げなくなった。
　それ以来、茅那の目には、人が隠している「二番目に好きなもの」や「二番目に強い感情」が文字として見えるようになる。
　厳格な校長が二番目に言いたいのは「早く帰りたい」。
　勇気を出して告白した生徒の口から出たのは、「一番好き」ではなく「二番目に好き」。
　笑ってしまうほど情けない本音が次々と暴かれる一方、湖畔学園では、人間の第一希望を奪う黒いペンと穴あけパンチが使われ始めていた。
　名前や願いを書いた紙に穴を開けられた者は、自分が一番好きな人や、一番進みたかった道を口にできなくなる。
　騒動の背後にあるのは、湖畔の廃礼拝堂を根城にする「永遠の神殿」。
　彼らは、一番好きなものを失う苦しみから人々を救うため、誰もが二番目の選択だけで生きる世界を作ろうとしていた。
　茅那は、幼なじみの太一や、行動力だけは誰にも負けないありす、毒舌ながら鋭い桜桃たちとともに、透明な靴と願いを奪う仕組みを追っていく。
　しかし、調べるほど太一の不審な行動が浮かび上がる。
　校舎裏に「湖畔へ行け」と書いたのも太一。
　一年前の湖畔で、透明な靴を手に泣いていたのも太一。
　そして茅那には、太一とキスをした記憶だけがない。
　やがて明らかになるのは、一年前、茅那が湖で心肺停止状態になっていたという事実だった。
　太一は茅那を生き返らせるため、透明な靴に願った。
　その代償として差し出されたのは、茅那が太一を一番好きだった記憶。
「君のために世界を壊す」
　そう告げる太一に、茅那は答える。
　自分を守るためであっても、自分の気持ちや選択を勝手に差し出してほしくない、と。
　傷つかない二番目の世界を選ぶのか。
　失敗するかもしれなくても、自分の一番を自分で選ぶのか。
　透明な靴、黒い死亡予告、穴だらけの願いカード、煮凝りに映る忘れられたキス。
　笑える異常現象が、やがて学校全体の人生を奪う危険な仕組みへ変わっていく、青春異能力サスペンス。

透明な靴は、二番目に好きな世界へ走る